綠建築標章為綠色工廠標章認定資格之一，由內政部認定。

經濟部產業發展署推動綠色工廠標章，將視工廠廠房是否取得內政部綠建築標章，並就取得綠建築標章與通過清潔生產評估系統符合性判定之重疊區域，頒發綠色工廠標章。

我國綠建築(EEWH)評估系統及標章制度評估範疇包括生態(Ecology)、節能(Energy Saving)、減廢(Waste Reduction)、健康(Health)等4大範疇，評估指標包括「綠化量」、「基地保水」、「水資源」、「日常節能」、「二氧化碳減量」、「廢棄物減量」、 「污水垃圾改善」、「生物多樣性」及「室內環境」等9大指標。為僅次於美國 LEED標章制度，全世界第二個實施的綠建築評估系統。

綠建築標章評估方式，依建築物類型，已訂定各類綠建築評估手冊以進行評估，如下表。工廠可視實際情形，選擇合適之評估方式，以取得標章，如綠建築評估手冊─廠房類(EEWH-GF)、綠建築評估手冊─舊建築改善類(EEWH-RN)等，皆可符合綠色工廠標章認定之綠建築資格。