工廠進行清潔生產評估時，原則上應考量完整之工廠登記範疇，範疇內所有與生產有關之項目皆應進行評估，但考量工廠實際之生產情形，依不同之產品產線，可能各具獨立之生產作業環境，不同的權責部門、例如在相同的工廠登記範疇下，具一棟以上廠房，生產不同產品，因此在申請時，可接受申請工廠自訂評估範疇，唯自訂評估範疇應詳加說明原因，後續審查作業亦將由評審人員審核評估範疇之合理性，綠色工廠標章之授權使用說明，亦將記載工廠符合標準之範圍。